Pippin Pulse脉冲场电泳系统
—高性价比的大分子DNA检测设备
长读长测序(又称三代测序)、合成生物等诸多技术应用都涉及对超长DNA片段的分离与分析。普通的琼脂糖凝胶电泳是借助琼脂糖凝胶的分子筛作用,核酸片段因其分子量或分子形状不同,电泳移动速度有差异而分离。然而这项技术一般只能分离10 kb以下的小分子DNA,更大的DNA分子用普通琼脂糖凝胶电泳无法达到分离的目的,从而限制了染色体DNA的分离、大片段基因组文库构建、生物物种鉴定、病原微生物基因分型、人类染色体内切酶物理图谱分析等方面的研究。而脉冲电场技术通过切换凝胶内的电场方向,能够驱使DNA分子在凝胶内前后方向来回运动,有效地降低大分子核酸片段的迁移速率,同时由于小分子核酸片段改变方向的速率要比大分子核酸片段快,因此通过脉冲场电泳技术,可以有效将大分子DNA片段进行分离和分析。
Pippin Pulse脉冲场电泳系统
美国Sage Science公司的Pippin Pulse脉冲场电泳系统可对长达430kb的超长DNA片段进行高效的电泳分离,而且仪器体积小巧不占空间。用户可通过PC端选择预设程序(如下图)或自定义程序进行大分子DNA片段的脉冲场凝胶电泳分离,程序可自定义使用户的应用更加广泛和灵活。
使用Pippin Pulse对大分子DNA进行电泳分离后的结果如下图所示:
- 应用案例1
2020年发表在Nature Biotechnology上的一篇文献中,研究人员对无角牛进行基因组测序组装和表型分析。其中Pippin Pulse用于牛肝脏基因组提取后的质控以及打断后(50kb)片段分布质控,随后联合Nanopore测序平台进行文库构建和下游测序分析。
- 应用案例2
原文链接:https://doi.org/10.1101/2022.03.11.483979
- 附:Pippin Pulse近三年部分发表文献list
期刊 | 文献名称 | 合作平台 | 物种类型 |
Nature Scientific Reports | Epitachophoresis is a novel versatile total nucleic acid extraction method | Roche illumina | FFPE组织样本肺癌细胞系 |
Nature Biotechnology | Genomic and phenotypic analyses of six offspring of a genome-edited hornless bull | Naonopore | 牛 |
Nature Communications Biology | Telomere-to-telomere gapless chromosomes of banana using nanopore sequencing | Naonopore | 香蕉 |
G3 Genes Genomes Genetics | The Genome Sequence of the Octocoral Paramuriceaclavata – A Key Resource To Study the Impact of Climate Change in the Mediterranean | Naonopore | 珊瑚 |
BioRxiv Preprint | The role of Staphylococcus agnetis 1 and Staphylococcus hyicus in the pathogenesis of 2 buffalo fly skin lesions in cattle | Naonopore illumina | 金黄色葡萄球菌 |
BioRxiv Preprint | A compendium of novel genomics technologies provides a chromosome-scale 1 assembly and insights into the sex determining system of the Greenland Halibut | PacBio | 比目鱼 |
GigaScience | Canfam GSD: De novo chromosome-length genome assembly of the German Shepherd Dog (Canis lupus familiaris) using a combination of long reads, optical mapping, and Hi-C | PacBio | 牧羊犬 |
G3 Genes Genomes Genetics | De novo whole-genome assembly and resequencing resources for the roan (Hippotragus equinus), an iconic African antelope | 10×Genomics | 羚羊 |
BioRxiv Preprint | Genomic resolution of cryptic 1 species diversity in chipmunks | 10×Genomics | 金花鼠 |
Prenatal Diagnosis | Rapid prenatal diagnosis of Facioscapulohumeral Muscular Dystrophy 1 by combined Bionano optical mapping and karyomapping | illumina | 人产前筛查 |
APG BIO 作为美国Sage Science公司Pippin Pulse脉冲场电泳系统在大中华区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收系统的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。APG BIO将一如既往地支持越来越多的Sage Science用户。
▼更多 Pippin Pulse详情,请联系我们▼
APG BIO
地址:上海市闵行区友东路358号闵欣大厦1号楼701/703/705室
电话:021-54583565
邮箱:info@apgbio.com
网址:www.apgbio.com
▼更多精彩内容,请扫码关注我们▼